Akreditasi perguruan tinggi merupakan sebuah bentuk komitmen perguruan tinggi untuk mempertahankan kualitas layanan pendidikan bagi masyarakat. Stikes Kesdam IX/Udayana telah melaksanakan persiapan sejak 8 bulan sebelum akreditasi tahun 2025 berakhir. Stikes Kesdam IX/Udayana membentuk tim akreditasi yang telah mempersiapkan seluruh laporan yang dibutuhkan sehingga dapat dilakukan pengunggahan dokumen tepat enam bulan sebelum akreditasi berakhir. Setelah melalui proses antrian yang cukup lama, akhirnya Stikes Kesdam berhasil mempertahankan akreditasi institusi yang dibuktikan dengan dikeluarkannya Sertifikat Akreditasi oleh Ban-PT pada bulan Oktober 2025. Informasi ini juga telah disampaikan oleh Kepala PMI Stikes Kesdam IX/Udayana kepada seluruh civitas melalui grup WhatsApp.